在机构进行逐步过渡的同时，针对很多设计院在项目管理人员配备、项目管理和横向协调能力不足的情况，也可以逐步探索项目管理体系的调整与人才的逐步培养。在项目管理体系上，在强矩阵模式无法一步到位的情况下，先逐步探索平衡矩阵的模式，项目负责人与各专业所所长在项目人员的选择、项目过程的控制、项目结束后的考核分配上，进行权限的分配。这样既不会突然打破原先的利益格局，造成很大的动荡，也有利于项目负责人的逐步培养。